AI創薬 3時限目

化合物の構造を表現する方法として「フィンガープリント」がある。
RDKitではフィンガープリントを扱える。

(1)インフルエンザ治療薬タミフルで使われている「オセルタミビル（oseltamivir）」で試す。
pubchemを検索。

(2)検索結果からカノニカルSmileを取得
CCC(CC)OC1C=C(CC(C1NC(=O)C)N)C(=O)OCC

(3)カノニカルSmileからRDKitのMolオブジェクトを作る。

(4)MolオブジェクトからRDKitフィンガープリントを取得する。
dictionary構造になっている。

(4)フィンガープリントを画像化。
2048個の各階層を画像にし、並べる。